کنگره سالانه جامعه اسلامي دانشجويان در تاريخ اول مرداد ماه1389 در محل اردوگاه شهيد باهنر تهران برگزار گرديد. در اين کنگره اساسنامه جامعه اسلامي دانشجويان که براساس آيين نامه تشکل هاي اسلامي دانشجويان مصوب وزارت علوم تحقيقات و فناوري اصلاح گرديده بود به تصويب کنگره رسيد.
ضمنا انتخاب شوراي مرکزي جامعه اسلامي دانشجويان نيز در اين کنگره برگزار گرديد که هيئت برگزاري و هيئت نظارت بر اين انتخابات از سوي دفاتر دانشگاهي جامعه اسلامي دانشجويان انتخاب گرديده بودند. افراد انتخاب شده در اين انتخابات به شرح ذيل مي باشند.
برادران:
1- محسن محمدي از دانشگاه رازي کرمانشاه
2- حامد تيموري از دانشگاه محقق اردبيلي
3- ناصر فرزان فر از دانشگاه آزاد سبزوار
4- امير قرباني پور از دانشگاه فردوسي مشهد
5- محمد پهلوان از دانشگاه علوم پزشکي مشهد
6- سيد علي موسوي از دانشگاه زابل
خواهران:
1- پناهي از دانشگاه علوم پزشکي گيلان
2- ياوري نژاد از دانشگاه زابل
3- ربيعي ايراني از دانشگاه محقق اردبيلي
همچنين در اين انتخابات براي انتخاب سه عضو هيئت عالي نظارت جامعه اسلامي دانشجويان نيز راي گيري صورت گرفت و اعضاي ذيل انتخاب شدند:
1- ايوب توکليان از دانشگاه علوم پزشکي مشهد
2- جواد سميعي پور از دانشگاه آزاد سبزوار
3- محسن رستمي از دانشگاه علوم قضائي